錄組分析平臺.png)
真核生物有參考基因組的轉(zhuǎn)錄組分析平臺
基于已知的基因組序列和注釋信息，以新一代高通量轉(zhuǎn)錄組測序（RNA-Seq）數(shù)據(jù)作為輸入，根據(jù)測序數(shù)據(jù)與參考基因組的序列比對，識別新的轉(zhuǎn)錄位點（新基因）、新的可變剪接事
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真核生物無參考基因組的轉(zhuǎn)錄組分析平臺
以新一代高通量轉(zhuǎn)錄組測序（RNA-Seq）數(shù)據(jù)作為輸入，從頭（de novo）組裝轉(zhuǎn)錄本，構建轉(zhuǎn)錄組（Unigene庫），并對Unigene進行功能鑒定，以及結構和表達量分析。
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蛋白質(zhì)組分析平臺
可以進行標準分析和個性化分析，其中標準分析包括：蛋白表達分析和蛋白注釋分析。設定參數(shù)后點擊提交進行分析，分析完成后在流程定制頁面下生成標準化結題報告，實現(xiàn)一鍵式
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錄組（ONT）分析平臺.png)
全基因組重測序分析平臺
面向無任何生物信息基礎的科研工作者開發(fā)的集成式分析流程，其部署在高性能服務器上，可以快速完成數(shù)據(jù)質(zhì)控、序列比對、SNP/InDel/SV突變檢測、突變注釋、突變基因
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微生物多樣性分析平臺
可以進行標準分析和個性化分析，其中標準分析包括：物種分類分析（包括：群落結構分析、物種Heatmap、物種系統(tǒng)進化樹）、單樣品多樣性分析（α- 多樣性指數(shù)、稀釋曲線
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宏基因組分析平臺
一款結合多年宏基因組項目分析經(jīng)驗開發(fā)的一鍵式標準化集成式分析平臺：分析涵蓋了目前微生物宏基因組研究的主流分析內(nèi)容，分析內(nèi)容豐富全面，分析結果以結題報告的形式給出。
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分析平臺.png)
學有參考基因組的轉(zhuǎn)錄組分析平臺.png)
學小RNA測序分析平臺.png)
學長鏈非編碼RNA測序分析平臺.png)
tab文件.png)
表格文件轉(zhuǎn)tab文件
將xls/xlsx格式的excel文件轉(zhuǎn)換為tab分隔的文本文件，包含多個sheet的文件，每個sheet都會轉(zhuǎn)換為一個文本文件，文件名為sheet的名稱。
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基因功能注釋
對通過與數(shù)據(jù)庫的比對，對FASTA格式文件的序列進行功能注釋。主要關注Result/Integrated_Function.annotation.xls這個表格和KEEG分析出的代謝通路圖。
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BLAST
基于局部比對算法的序列比對搜索工具。BLAST程序可根據(jù)database和infile文件序列類型自動從四種比對程序（blastn、blastp、blastx和tblastn）中選擇合適的程序
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繪制GO、KEGG分類富集圖
對給定的基因集結合注釋信息繪制GO分類富集圖、KEGG分類富集及通路富集圖，計算出基因的P_value和Corrected_P-value，定位基因最可能相關的GO term。
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根據(jù)ID列表提取fasta序列
根據(jù)ID列表提取fasta序列：根據(jù)給定的序列ID，到目標序列文件中提取出對應ID的序列。注意：ID文件的后綴只能是txt、list、id，且必須為文本文件
立即打開加權基因共表達網(wǎng)絡分析
加權基因共表達網(wǎng)絡分析(WGCNA)是一種從表達數(shù)據(jù)中挖掘基因模塊（module）信息的算法，可以用于分析各種表達譜數(shù)據(jù)，不僅是芯片數(shù)據(jù)，還可以用于二代測序數(shù)據(jù)得到
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簡單重復序列分析
分析fasta序列的SSR(Simple Sequence Repeat)標記，用于后續(xù)的實驗分析及驗證，主要應用于轉(zhuǎn)錄本或者Unigene、CDS、EST等序列的SSR標記檢測，及標記結果的引物設計。
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